Piyelonefritin en sık görülen nedenleri Entembacteriaceae ailesinin (gram-negatif çubuklar) temsilcileridir. Bunların yaklaşık %80'ini (akut komplikasyonsuz vakalarda) Escherichia coli oluşturur; daha az görülen patojenler ise Proteus türleri, Klebsiella türleri, Enterobacter türleri, Citrobacter türleridir.
Piyelonefrit, böbrek pelvisi ve kalikslerinde, tübülointerstisyel dokuda ve sıklıkla glomerüler aparatta hasarla seyreden, böbreğin enfeksiyöz ve inflamatuar bir hastalığıdır.
Medüller sünger böbrek, kistik böbrek hastalıkları adı verilen grupta yer alır; böbrek piramitleri ve papillaları içindeki toplayıcı tübüllerin segmentlerinde ektaziler ve kist oluşumu ile karakterizedir.
Endemik Balkan nefropatisi, renal tubulointerstisyumun kronik, inflamatuar olmayan bir hastalığıdır. Bu hastalık yalnızca Sırbistan, Romanya, Bosna-Hersek, Hırvatistan ve Bulgaristan'daki Tuna Nehri havzasında görülür.
Serum kalsiyum konsantrasyonunda kalıcı bir artışla böbrek dokusunda birikir. Kalsiyumun ana hedefi renal medulla yapılarıdır. Tubulointerstisyumda atrofik değişiklikler, fibroz ve çoğunlukla mononükleer hücrelerden oluşan fokal infiltratlar görülür. Hiperkalsemi çeşitli nedenlerle oluşur.
Kronik tübülointerstisyel nefritin (analjezik nefropatisi) böbrek dışı semptomları, ilaç alerjisi triadı dahil olmak üzere, NSAİİ'lerin karakteristiği değildir.
Kronik ilaç kaynaklı tubulointerstisyel nefrit, diğer birçok kronik nefropati formunun aksine, potansiyel olarak önlenebilir. Çoğu vaka, NSAID'lerin ve narkotik olmayan analjeziklerin uzun süreli kullanımıyla ilişkilidir; bunları tanımlamak için analjezik nefropati terimi kullanılır.
Kronik tubulointerstisyel nefrit, en önemlileri ilaçlar ve metabolik bozukluklar olmak üzere çeşitli nedenlerden kaynaklanır. Akut tubulointerstisyel nefrit gibi, kronik nefrit de yaşlı ve senil hastalarda çok daha sık görülür.
Akut tubulointerstisyel nefrit, renal interstisyum yapılarında belirgin inflamatuar değişikliklerle karakterize olup, esas olarak lenfositler (tüm hücrelerin %80'ine kadar) ve polimorfonükleer lökositler tarafından infiltrasyon görülür; granülomlar daha az sıklıkla bulunur.
