Lupus nefriti, tipik bir immün kompleks nefriti olup, gelişim mekanizması sistemik lupus eritematozusun patogenezini bir bütün olarak yansıtır. Sistemik lupus eritematozusta, hem birincil genetik bir defektten hem de T lenfositlerinin disfonksiyonundan ve CD4+ ve CD8+ hücrelerinin oranındaki azalmadan kaynaklanabilen B hücrelerinin poliklonal aktivasyonu meydana gelir.