Çalışma erken doğumla bağlantılı bakterileri tanımlıyor

North Carolina State Üniversitesi'ndeki araştırmacılar, bazen bakteriyel vajinozis (BV) ve erken doğumla ilişkilendirilen bakteriler olan birden fazla Gardnerella türünün aynı vajinal mikrobiyomda bir arada bulunabileceğini buldular. mSystems dergisinde yayınlanan bulgular, Gardnerella'nın insan sağlığı üzerindeki etkisine dair artan anlayışa katkıda bulunuyor.

Gardnerella, vajinal mikrobiyomda yaygın olan bir grup anaerobik bakteridir. Bu bakterilerin yüksek seviyeleri BV'nin bir özelliğidir ve erken doğum riskinin artmasıyla ilişkilidir, ancak hastalığa dair hiçbir kanıt olmayan kadınlarda da bulunurlar.

Kuzey Carolina Eyalet Üniversitesi'nde nüfus sağlığı ve patobiyolojisi alanında doçent ve makalenin ortak yazarlarından Ben Callahan, "Gardnerella'daki çeşitliliği anlamaya çalışıyorduk" diyor.

"Bilim insanları Gardnerella'nın bireysel türlerini incelemeye yeni yeni başladılar, bu yüzden farklı türlerin farklı sağlık etkilerine sahip olup olmadığını henüz bilmiyoruz. Bizim asıl hedefimiz Gardnerella'nın ekolojisini incelemekti."

Vajinal mikrobiyom dizilemesinin benzersiz bir zorluğu, tüm örneklerin öncelikle konak DNA'sından oluşması ve bu nedenle mikrobiyal veri çıkarmanın daha pahalı ve emek yoğun olmasıdır. Araştırma ekibinin ilk görevi, mikrobiyom verilerinden farklı Gardnerella türlerinin tanımlanmasına olanak tanıyan bir metodoloji geliştirmekti.

"Vajinal mikrobiyomu incelemek için mevcut araçlar tüm Gardnerella'ları tek bir tür olarak ele alıyor," diyor Kuzey Carolina Eyalet Üniversitesi'nde doktora sonrası araştırmacı ve makalenin baş yazarı Hannah Berman. "Bu çalışmayı yapmak için kendi Gardnerella genom veri tabanımızı oluşturmamız ve farklı Gardnerella türlerini tanımlamak için bir yöntem geliştirmemiz gerekiyordu. Umarım bu, daha fazla araştırmacının Gardnerella'nın çeşitliliğini incelemesine de olanak tanır."

Araştırma ekibi üç kohorttan dizileme verilerini inceledi: iki rastgele hamile kadın popülasyonu ve erken doğum geçmişi olan bir popülasyon. Örneklerdeki Gardnerella'nın metagenomik dizilerini analiz ederek belirli Gardnerella türleri ile erken doğum arasında bir ilişki olup olmadığını gördüler.

"Açık delil"i bulamasalar da, iki şaşırtıcı keşifte bulundular.

Öncelikle örnekler arasında Gardnerella'nın potansiyel 14. türünü tespit ettiler; bu çalışmadan önce sadece 13 tür tespit edilmişti.

Ayrıca Gardnerella içeren örneklerin çoğunda, aynı mikrobiyomda birden fazla Gardnerella türünün bir arada bulunduğunu buldular: Ayrı örneklerde, bilinen 14 Gardnerella türünün ikisi ile tamamı arasında bir sayı bulundu.

Callahan, "Genellikle, bir bakteri türü bir ortamı kolonize ederse, aynı ekolojik nişi işgal eden ve aynı kaynakları tüketen yakın akrabalarını dışlamasını bekleriz," diyor. "Bakteriler söz konusu olduğunda her şeyin mümkün olduğunu sık sık söylerim, ancak bu hala alışılmadık bir durum. Ayrıca, genel mikrobiyal yük daha yüksek olduğunda, Gardnerella'nın bu yükün daha büyük bir bölümünü oluşturduğunu gördük.

"Gardnerella'nın erken doğumla bağlantılı olduğuna dair kanıtlar birikmeye devam ediyor, ancak bu ilişkinin detayları karmaşık. Bu çalışmada, Gardnerella'nın tek bir zararlı türünü bulamadık - belki de hepsi zararlıdır. Bu, hikayenin sonu değil."

Araştırmacılar, türlerin bir arada yaşaması ve mikrobiyom bileşimi konularını daha fazla incelemeyi umuyorlar.

Callahan, "Vajinal mikrobiyom yeterince takdir edilmiyor," diyor. "Örneğin, genellikle tek bir Lactobacillus türü tarafından domine ediliyor ve bu da diğer bakterileri dışlayan bir ortam yaratıyor. O gittiğinde, Gardnerella ortaya çıkıyor. Peki bu bakteriler nasıl etkileşime giriyor?

"Bu soruların cevapları BV için daha etkili tedavilere ve erken doğumu tahmin etme ve önleme yollarına yol açabilir. Bu çalışma bu süreçte önemli bir adımdır."