Primer tüberkülozda lezyon genellikle lenf düğümlerinde, akciğerlerde, plevrada ve bazen diğer organlarda lokalize olur: böbrekler, eklemler, kemikler, periton. Spesifik inflamasyon alanı çok küçük olabilir ve muayene sırasında gizli kalabilir. Lezyon büyükse genellikle hastanın klinik ve radyolojik muayenesi sırasında tespit edilir.