Kronik özofajit, kural olarak, akut özofajitten gelişir ve pratik olarak aynı etiyolojik faktörlere dayanır. İyileşmeyen ülserlerin oluşumu, sikatrisyel stenozu olan uzun süreli inflamatuar süreçlerin ortaya çıkması, tümörler ile karakterize edilebilirler. Kronik özofajit hem spesifik hem de spesifik olabilir (tüberküloz, sifiliz, aktinomikoz).