Yemek borusunun atoni ve felci, yemek borusunun nöromüsküler aparatının fonksiyonel bozuklukları ile karakterize, nedenleri o kadar çoktur ki, bunları kapsamlı bir sistematizasyona tabi tutmak mümkün değildir.
Yemek borusu genişlemeleri, yemek borusu boşluğunun tüm uzunluğu boyunca devasa bir genişleme, duvarlarında karakteristik morfolojik değişiklikler ve kardiyospazm adı verilen kardiyak segmentin keskin bir şekilde daralması ile karakterizedir.
Yemek borusuna gelen mekanik yaralanmalar, zamanında ve tam olarak uygulanan tedavi önlemlerine rağmen sıklıkla ölümle sonuçlanan en ciddi yaralanmalar arasındadır. Yemek borusuna gelen anatomik yaralanmalar (yaralar, kopmalar, yabancı cisimler tarafından delinmeler) göğüs cerrahlarının sorumluluğundadır.
Plummer-Vinson sendromu, ağız boşluğu, yutak ve yemek borusunun mukoza zarının atrofisi ile karakterizedir ve birçok sistemik semptomla kendini gösterir: yutma bozukluğu, disfaji, dilde yanma hissi
Özofagusun trofik hastalıkları, lokal veya genel patojenik faktörlerin sonucu olarak ortaya çıkar ve mukoza zarında ve daha derin katmanlarında çeşitli patomorfolojik değişikliklerle kendini gösterir.
Yemek borusunun temas ülseri, krikoid kıkırdak plakası arasında önde ve altıncı boyun omurunun gövdesi arasında arkada bulunan yemek borusu duvarlarının uzun süreli baskı teması sonucu oluşan nadir bir hastalıktır.
Özofageal skleroderma, sistemik sklerodermanın belirtilerinden biri olup, ilerleyici bir hastalık olup bağ dokusunda skleroz gelişimi ve arteriollerde obliterasyon hasarı ile karakterizedir.
Yemek borusu aktinomikozu, nadir görülen bir hastalıktır ve ancak yemek borusunun mukoza zarının hasar görmesi ve enfekte etkenlerin içinde kalması durumunda ortaya çıkabilir.