Kene kaynaklı ensefalit, ixodid keneleri tarafından bulaşan bir flavivirüs tarafından meydana gelir, taze süt yoluyla enfeksiyon vakaları tanımlanmıştır. 10 günlük bir kuluçka döneminden sonra, nezle, ateş, baş ağrısı, eklem ağrısı ve CNS lezyonları (ensefalit - %30, menenjit - %60, meningoensefalit - %10) olarak kendini gösterir. Endemik bölgelerde kene kaynaklı ensefalite karşı aşılama, insidansın azalmasına yol açmıştır