HCV genomu, 3 yapısal (nükleokapsid protein çekirdeği ve zarfın nükleoproteinleri E1-E2) ve 5 yapısal (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) proteini kodlayan tek zincirli pozitif yüklü bir RNA ile temsil edilir. Bu proteinlerin her biri için, viral hepatit C'li hastaların kanında bulunan AT'ler sentezlenir.